Manuel Utilisateur Pour TSGQC ThermoSalinoGraph Quality Control

Buts du logiciel

Le logiciel TSGQC (ThermoSalinoGraph Quality Control) a été conçu pour valider, étalonner et corriger les mesures de salinité et de température acquises par les thermosalinographes (TSG) sur les navires marchands du SOERE SSS (Système d’Observation et d’Expérimentation pour la Recherche en Environnement sur la salinité de surface de la mer) :
1. Valider : attribution de codes de qualité aux mesures
2. Etalonner : prise en compte d’une dérive temporelle linéaire des capteurs
3. Corriger : à partir de données externes discrètes (prélèvements, mesures ARGO, CTD, XCTD, etc.)
5. Fonctionnalités

Mise en route

Le logiciel démarre dans la fenêtre ‘Command Window’ de MATLAB. Pour faciliter l’accès aux fichiers de données, l’utilisateur peut indiquer le répertoire de travail dans l’onglet supérieur de la fenêtre MATLAB. Le logiciel est initialisé par la commande suivante :
>> tsgqc
Les fonctions du logiciel sont activées quand un fichier TSG a été lu (p. 11)

Principales fonctions

1. Icones
Ouverture et lecture des fichiers p. 11
Ecriture des fichiers au format NetCDF p. 1716
Module d’impression des figures p. 2625
Zoom graphique p. 2423
Zoom graphique p. 2423
Fonction de ‘pan’ : déplacement des courbes dans les graphiques p. 2423
Module de validation – Attribution de codes qualité p. 2726
Sélection de limites temporelles p. 2524
Affichage du trajet du navire p. 2322
Affichage de la climatologie p. 2221
Module d’étalonnage p. 2928
Module d’interpolation de la position p. 3029
Module de correction p. 3130
Formulaire pour les meta-données p. 1716
Ecriture d’un fichier ‘log’ p. 3837
Pour activer une fonction, cliquez sur l’icône. L’icône s’éclaircit.
Pour désactiver la fonction, cliquer à nouveau sur l’icône.

2. Menus

Menu FILE
Ce menu comporte 4 fonctions :
Open Ouverture d’un fichier (TSG, bouteilles, etc,) p. 11
Save Sauvegarde des données au format NetCDF p. 1716
Export Sauvegarde des données au format ASCII p. 1817
 Les mesures du TSG
 Les mesures discrètes (bouteilles, CTD, ARGO,…)
Quit Fermeture du logiciel p. 4039

Menu Edit
Ce menu n’est pas fonctionnel

Menu Climatology
Ce menu permet de choisir le type de climatologie que l’on veut afficher sur les graphiques :
1. Annuelle
2. Saisonnière
3. Mensuelle
Le type de climatologie et la profondeur de celle-ci peuvent être choisis via le menu Option – Preferences (voir paragraphe suivant)

Menu Option
Ce menu permet de fixer des préférences pour le fonctionnement du logiciel. Ces choix portent sur :
 Le choix de la climatologie et sa profondeur p. 2120
 Les types de coefficients d’étalonnage
 Les graphiques
 Les valeurs des tests automatiques qui peuvent être appliqués via le menu QCauto

Menu QCauto

Ce menu permet de choisir les tests automatiques qui seront appliqués aux mesures du TSG. Les tests utilisent les valeurs limites définies dans le menu « Option – Preferences » (cf. paragraphe précédent).Le logiciel applique un code qualité BAD aux mesures qui sont en-dehors de limites de test.

Remarques

 Le logiciel ne possède pas de fonction Undo. Si les tests automatiques sont appliqués plusieurs fois lors d’une même session de traitement l’historique des tests n’est pas conservé.
 Les valeurs de salinités qui excèdent les min et max définis dans le menu « Option – Preferences » par l’utilisateur prennent la valeur BAD, à l’exception du test sur la vitesse du navire (Ship Speed) qui positionne le code à la valeur HARBOUR.
 Se méfier des tests automatiques. Par exemple, si les codes qualités des mesures sont positionnés à HARBOUR lorsque le navire est à quai, il est important de vérifier que les mesures sont correctes. Si les vannes ont été fermées et que les mesures sont mauvaises il faut que ces mesures aient un code qualité positionné à BAD. Pour les navires scientifiques, il est fréquent d’avoir une vitesse nulle en plein océan lors des stations de mesure, et le code de qualité dans ce cas sera à priori GOOD et non HARBOUR.

Menu Help
L’aide en ligne n’est pas fonctionnelle.

Ouverture d’un fichier

Plusieurs types de fichiers peuvent être lus par le programme :
*.arg Fichier de données ARGO généré par l’équipe de G. Reverdin (UMR LOCEAN) le long des routes des navires
*.ast Fichier TSG du navire des Terres Australes ASTROLABE
*.btl Fichier bouteilles au format ASCII
*.lbv Fichier TSG au format SODA utilisé sur les navires marchands (SOERE SSS)
*.nc Fichier TSG au format NetCDF
*.ora Fichier TSG au format ORACLE anciennement utilisé par le SOERE SSS
*.sdf Fichier TSG au format ORACLE anciennement utilisé par le SOERE SSS
*.spl Fichier de données discrètes ‘échantillons’ (XBT, CTD, etc.) au format ASCII (*.spl : ‘sample’)
*.transmit* Fichier TSG du navire de commerce NUKA ARCTICA
*.tsgqc Fichier TSG au format ASCII
*.xml Fichier au format XML. Ce format n’est pas actif.