Séroprévalence et caractérisation moléculaire du FMDV au Tchad

 Cette étude visait à déterminer la séroprévalence de la fièvre aphteuse chez les ruminants domestiques et à caractériser les souches virales en circulation dans trois régions du Tchad (Batha, Wadi Fira et Ennedi Ouest). Au total, 1520 échantillons de sérum (928 de bovins, 216 de caprins, 254 d’ovins et 122 de dromadaires) ont été prélevés et testés par le test ELISA PrioCHECK® FMDV NSP, pour détecter la présence d’anticorps induits par des protéines non structurales du virus de la fièvre aphteuse (en particulier la protéine 3ABC), correspondant à une infection passée par le virus de type sauvage. 9 échantillons de tissus épithéliaux des bovins ont été également prélevés pour l’isolement et la caractérisation du virus de la fièvre aphteuse. Les résultats sérologiques du test ELISA PrioCHECK® FMDV NSP montrent une séroprévalence globale de 40 % (602/1520), IC à 95 % [19-63]. Cependant, les séroprévalences de 84 %, 78 % et 84 % ont été estimées chez les bovins de plus de 5 ans respectivement aux Batha Est, Batha Ouest et Wadi Fira. Chez les bovins de moins d’un an, la séroprévalence était estimée à 67 % au Wadi Fira, 64 % au Batha Est et 59 % au Batha Ouest. Il a été constaté que ces taux de séroprévalence élevés obtenus dans les différentes zones étaient liés à des facteurs de risque favorisant la propagation de la maladie tels que le partage des pâturages avec d’autres troupeaux voisins, la combinaison de l’élevage bovin et ovin et l’âge des animaux. Les résultats du test de sérotypage ELISA PrioCHECK® FMDV types O et A et du test ELISA de compétition en phase solide (SPCE) (pour détecter les types SAT 1 et SAT 2) réalisés sur les sérums des jeunes animaux âgés de moins d’un an qui sont positifs au test ELISA PrioCHECK® FMDV NSP, montrent que les quatre sérotypes O, A, SAT 1 et SAT 2 ont circulé au Tchad en 2015. Cependant, le type SAT 2 dominait avec une séroprévalence globale de 43,3 % et était présent dans toutes les régions étudiées. Les analyses virologiques ont permis de caractériser le sérotype SAT 2 de la fièvre aphteuse et les analyses phylogénétiques de la séquence codante VP1 ont permis de déterminer le sérotype SAT 2 topotype VII, proche des souches virales trouvées au Cameroun en 2015 avec une similarité de 98,60%.

(Article en cours de revision dans la revue Veterinay Medicine and Science)

Abstract: This study aimed to determine the seroprevalence of Foot-and-Mouth Disease (FMD) in domestic ruminants and to characterize the virus strains circulating in three regions of Chad (Batha, Wadi Fira and West Ennedi). In total, 1520 sera samples (928 from cattle, 216 from goats, 254 in sheep and 122 from dromedaries) were collected for FMD serological analyses. Nine samples of bovine epithelial tissue were also collected for the isolation and characterisation of the foot-and-mouth disease virus. Serological results show an overall seroprevalence of 40%, 95% CI [19-63]. However, the seroprevalences of 84%, 78% and 84% were estimated in cattle over 5 years of age in East Batha, West Batha and Wadi Fira respectively. In cattle under one year of age, 67% seroprevalence was estimated in Wadi Fira, 64% in East Batha and 59% in West Batha. It was found that these high seroprevalence rates obtained in the different areas were linked to risk factors favouring the spread of the disease such as grazing sharing with other neighbouring herds; the combination of cattle and sheep breeding and the age of the animals. ELISA PrioCHECK® FMDV types O and A and inhouse solid phase competition ELISA (to detect types SAT 1 and SAT 2) serotyping results show that the four O, A, SAT 1 and SAT 2 serotypes circulated in Chad in 2015. However, the type SAT 2 dominated with an overall seroprevalence of 43.3%, and was present in the all regions investigated. The virological analyses permitted characterization of FMD serotype SAT 2. The phylogenetic analyses of the VP1 coding sequence allowed determining the serotype SAT 2 topotype VII, close to viral strains found in Cameroon in 2015 with a similarity of 98.60%