Souches d’E. coli O157 isolées des selles

Après la culture de 1677 échantillons de selles, un agent entéropathogène a été détecté dans 369 cas. Les virus (Rotavirus et Adénovirus) représentent 85,36% de ces agents ; E. coli O157 occupe la 3ème place après les salmonelles. L’identification des souches E. coli O157:H7 n’a pas été complète. La non fermentation du sorbitol a été le principal caractère biochimique d’orientation que nous avons utilisé. Ce caractère étant aléatoire [37, 38], nous avons passé outre ; ainsi, 23% des isolats humains d’E. coli O157 fermentaient le sorbitol. Nous nous sommes donc contentés, en fonction de nos moyens, de rechercher uniquement la présence d’Ag O157, mais pas l’Ag H7, ni les gènes Stx. Cependant, lors de la détection de l’Ag O157 avec le Dryspot-test, des réactions croisées ont été décrites avec E. hermannii, Citrobacter freundii, Aeromonas spp., Enterobacter cloacae, Shewanella putrefaciens et Salmonella Angoda à cause d’un antigène commun [1]. Un doute existe donc si l’identification d’E. coli O157 repose uniquement sur la recherche de l’Ag O157 par agglutination, sans identification biochimique complète grâce à une galerie complète. Etude préliminaire oblige, notre taux d’isolement d’E. coli O157 est faible mais reste dans la fourchette des données africaines [39, 40]. Parmi les 13 souches d’E. coli O157, une seule provient d’une selle glairosanglante, aspect pouvant éventuellement faire suspecter la bactérie. La présence d’E. coli O157 dans les selles d’enfants ne présentant qu’une simple diarrhée est fréquente; cela correspond habituellement à des formes bénignes ou asymptomatiques qui sont très difficiles à déceler. Ce taux de portage est élevé chez nos enfants (85%) ; il est le double de celui observé dans certains pays développés [31, 32]. A Dakar, même l’existence de symptômes évocateurs de gastroentérites à E. coli O157 (colite hémorragique, crampes abdominales…) n’entraine pas de facto une demande de recherche de cette bactérie. La recrudescence durant la saison sèche et chaude du taux d’isolement d’E. coli O157 a été documentée par diverses études européennes et américaines ; c’est aussi la période de survenue des épidémies [1, 31, 32]. Nous avons isolé 69% de nos souches pendant la saison des pluies, période chaude à Dakar. La région de Dakar comporte des endroits assimilables aux zones rurales. Là-bas, l’élevage d’animaux domestiques est fréquent de même que la stagnation d’eaux usées (eaux de pluie, eaux d’égouts…) ; autant de facteurs 51 environnementaux propice à la transmission et la propagation d’E. coli O157. On comprend alors que 46% des personnes hébergeant E. coli O157 résident dans le district « Dakar Nord » où ces conditions environnementales sont réunis [2, 16].

Souches d’E. coli O157 isolées dans les produits carnés

Nous avons retrouvé E. coli O157 chez les 3 animaux (bœuf, mouton, porc) chez lesquels nous l’avons recherché. Le taux global d’isolement est de 16,36% ; il est à 12,25% chez les bovins, 17% chez les ovins et 15% chez les porcins. Dans la littérature, les chiffres annoncés varient de 0,2 à 28% aussi bien dans les pays développés que dans certains PED [1, 39, 41, 42]. E. coli O157 a été isolé principalement de la viande 83% plutôt que dans les intestins (17%) des animaux que nous avons testés. Vu les conditions dans lesquelles nous avons observé les bouchers au travail, nous pensons comme rapporté dans la littérature [41, 43, 44], à une contamination des carcasses (viande) lors de l’abattage et du dépeçage de l’animal par contact avec les viscères ou les fèces. L’hygiène du matériel qu’ils utilisent est mauvaise. 4.4. Sensibilité aux antibiotiques La majorité des souches d’origine humaine est sensible aux antibiotiques testés, contrairement aux isolats d’origine animale chez lesquels la sécrétion de BLSE (55%) explique leur résistance aux Bêtalactamines. Cette résistance découlerait de l’utilisation à grande échelle des antibiotiques dans le domaine de l’élevage .