Modification de surfaces d’or par des films SAMs thiols inhibiteurs aux transferts de charge électrochimique

Modification de surfaces d’or par des films SAMs thiols inhibiteurs aux transferts de charge électrochimique

Etude bibliographique sur les monocouches auto-assemblées (SAMs) et les molécules soufrées 2MBI et 2MBIS-5-S

Généralités sur les monocouches auto-assemblées (SAMs) 

Les monocouches auto-assemblées appelées SAM (de l’anglais Self-Assembled Monolayer) sont des édifices moléculaires auto-organisés formés par adsorption spontanée de molécules amphiphiles sur un substrat (figure I-1) [1]. La nature chimique de la molécule amphiphile et le substrat impliqué dans cet assemblage est variée (tableau I.1). Ainsi, après plusieurs dizaines d’années de recherche on peut répertorier l’adsorption d’alcanethiols, de sulfures ou de disulfures de dialkyles sur des métaux nobles comme l’or, l’argent, le platine ou non nobles, d’alcools, d’amines ou d’isonitrile sur platine, et d’acides carboxyliques sur oxydes d’aluminium ou d’argent et d’organosiloxanes sur des surfaces hydroxylées.  Figure I-1 Schéma d’une monocouche auto-assemblée de n-dodécanethiol sur un substrat anatomiquement plat [1] La formation de la SAM sur le substrat tient essentiellement au caractère amphiphile des molécules. Elle procède en une première étape de chimio-sorption sur les atomes du substrat, suivie par une seconde organisation qui provient des forces intermoléculaires faibles entre les chaînons alkyles des molécules chimisorbées. Schématiquement (figure I-2), une molécule amphiphile peut être divisée en trois parties, chacune jouant son rôle dans l’élaboration de la SAM: une tête, une queue et une partie terminale. Figure I-2 Représentation schématique d’une molécule amphiphile  La tête de la molécule est conçue pour présenter une forte affinité pour la surface du substrat. On observe un positionnement de la tête sur un site spécifique de la surface par l’intermédiaire d’une liaison chimique (chimisorption). Celle-ci peut être covalente comme dans le cas de l’adsorption d’alkyles de trichlorosilanes sur une surface hydroxylée (liaison Si-O), ionique (adsorption des acides carboxylique sur (AgO/Ag) ou pseudo covalente où la liaison formée intervient dans l’organisation de la SAM.  La queue est constituée de chaînes alkyles simples [2] pouvant inclure un ou plusieurs groupes fonctionnels (fonction amide [3-5], phényle [6-8]) susceptibles de modifier la nature des forces intermoléculaires. Cette partie est en effet impliquée dans l’établissement des interactions intermoléculaires faibles de Van Der Waals responsables de l’organisation à longue distance. L’organisation confère aux molécules des positions symétriquement équivalentes sur le substrat. La partie terminale est constituée d’un groupement fonctionnel ou polyfonctionnel. L’importance de son encombrement, sa charge, etc. peuvent modifier l’organisation de l’ensemble et les propriétés de la SAM 

Historique

Dès les années 1930, les monocouches d’amphiphiles étaient utilisées pour le contrôle des propriétés de mouillage des métaux constituant les condenseurs des machines à vapeur [12]. En effet, la condensation d’un film d’eau à la surface du plateau métallique des condenseurs diminue l’efficacité de la conversion de la phase vapeur. Très tôt, on s’aperçoit que les molécules amphiphiles formaient une monocouche à la surface du substrat métallique via un groupement métallophile, alors que les chaînes hydrocarbonées s’alignaient orthogonalement à la surface. La formation de telles monocouches a été démontrée dès 1946 par Bigelow et al [13]. Ils ont préparé un film monomoléculaire par adsorption d’alkylamines sur un support de platine. Ainsi, ils ont montré que des molécules polaires dans des solvants non polaires pouvaient s’adsorber pour former des monocouches bien organisées sur des surfaces planes. Bien qu’elles soient de très faible épaisseur (quelques nanomètres), ces monocouches peuvent modifier complètement les propriétés physicochimiques de ces surfaces (hydrophobicité, mouillabilité,…). L’étude des monocouches auto-assemblées n’a suscité un intérêt croissant qu’à partir du début des années 80, avec l’apparition de nouvelles techniques de caractérisation telles que la microscopie à force atomique (Atomic Force Microscopy, AFM, 1986) et la microscopie à effet tunnel (Scanning Tunneling Microscopy, STM, 1981). Ainsi, des travaux sur les monocouches auto-assemblées apparaissent, tels ceux de Sagiv dont le premier article démontrant la formation de monocouches d’octadécyltrichlorosilane (OTS) bien organisées sur SiO2 par chimisorption directe [14] et les SAMs de Nuzzo et Allara sur l’immobilisation de disulfures sur or [15]. Ce n’est qu’à partir d’une série de publications séparées de Finklea, Porter, Nuzzo ou Rubinstein [16,17], en 1987, puis de Whitesides [18,19] que des articles apparaissent sur des SAMs à base d’alkylethiols.

Types des SAMs

Les monocouches auto-assemblées se divisent en deux classes principales: la première formée de thiols, sulfures ou disulfures adsorbés sur un métal pur tel que l’or, l’argent, le mercure, le platine ou le cuivre et la deuxième faite de silanes le plus souvent sur un oxyde de silicium ou d’aluminium (figure I-3). Dans les deux cas l’interaction de la molécule avec le substrat est une liaison covalente, ce qui confère une grande stabilité à la monocouche. En plus, les interactions entre les molécules elles-mêmes peuvent être de nature covalente ou non-covalente selon la nature chimique de la molécule, accroissent la stabilité de la structure.  Aussi les SAMs thiols immobilisés sur substrat d’or après adsorption forment une liaison covalente avec (Au-S). Aussi, des interactions de type de Vander Waals sont créées entre elles. Alors que les silanes peuvent créer trois liaisons covalentes avec les molécules voisines ou le substrat contrairement aux alcanes-thiols qui n’ont qu’un seul point d’ancrage avec le substrat. Les silanes forment ainsi un réseau tridimensionnel de liaisons covalentes très fortes, appelées siloxanes (Si-O-Si). Figure I-3 Monocouches auto-assemblées sur Au, SiO2 et surface d’oxyde métallique (OM) [20] Dans ce qui suit, nous allons nous focaliser sur les monocouches auto-assemblées sur or.

Monocouches auto-assemblées sur or 

Généralités

Depuis les travaux de Nuzzo [15] et Allara en 1983, les monocouches auto-assemblées sur or ont été largement étudiées en raison de leurs multiples domaines d’applications (capteurs [21], électrocatalyse [22], …). Ce type de fonctionnalisation conduit à la formation spontanée d’une monocouche sur un substrat avec un haut degré d’organisation [23] (figure I4). Par définition une SAM correspond à un édifice moléculaire formé à partir d’entités organiques greffées sur une surface. Elle est qualifié d’auto-assemblée car le dérivé organique s’adsorbe et s’organise spontanément sur le substrat. Pour cela, les précurseurs de SAMs doivent posséder différents groupements, chacun assurant un rôle au sein de la monocouche:   La fonction d’accroche: c’est la fonction chimique permettant l’adsorption de la molécule organique sur le substrat (thiol, disulfure, dialkylsulfure, dithiol, acide thioctique,…).  L’espaceur: il est généralement constitué d’une chaîne alkyle d’une dizaine de carbones permettant l’organisation par des interactions de Vander Waals.  Le groupement fonctionnel: c’est l’entité qui détermine les propriétés physicochimique de la monocouche. La stratégie de synthèse des précurseurs permet une grande variabilité des groupements fonctionnels modulant les propriétés physiques et chimiques de la surface. Figure I-4 Schéma d’une monocouche auto-assemblée sur l’or modifiée de [24]

Types de molécules utilisées

Il est difficile de montrer un modèle et donner des conclusions recueillant le consensus de la communauté scientifique. Il est cependant possible d’extraire des tendances communes à certaines familles dont nous présentons un résumé pour les deux les plus étudiées: les alcanes mono (alcanethiols) ou dithiolés (dialcanethiols) et les molécules conjuguées et selon les besoins les SAMs obtenues peuvent être fonctionnalisées ou non. a. SAMs d’alkanes-thiols Dans le cas particulier de l’alcane-thiol non fonctionnalisé, les trois parties qui constituent la molécule sont: 1. Le groupe de tête est un atome de soufre. 2. La chaîne de séparation est constituée d’une succession de groupements méthylènes CH2 (chaîne aliphatique). 3. Le groupement terminal est un simple méthyle: CH3 (figure I-5).

Table des matières

Chapitre I Etude bibliographique sur les monocouches auto-assemblées (SAMs)
et les molécules soufrées 2MBI et 2MBIS-5-S
I.1.Généralités sur les monocouches auto-assemblées (SAMs)
I.1.1. Définition
I.1.2. Historique
I.1.3. Types des SAMs
I.1.4. Monocouches auto-assemblées sur or
I.1.4.1. Généralités
I.1.4.2. Types de molécules utilisées
a. SAMs d’alkanes-thiols
b. SAMs à Molécules π-conjuguées (SAMs à cycles aromatiques)
I.1.4.3. Formation des SAMs sur l’or
a. Préparation des SAMs
b. Cinétique de formation
c. Avantages de l’or
I.1.4.4. Caractéristiques des SAMs sur substrat en or
a. Nature des molécules organo-soufrées (adsorbats)
b. Nature de la liaison Au-S
c. Mécanisme d’adsorption
I.1.4.5. Applications des SAMs
I.2. Synthèse bibliographique sur les molécules 2MBI et 2MBIS-5-S
I.2.1. Présentation de la molécule 2MBI
I.2.2. Présentation de la molécule 2MBI-5-S
I.2.3.Formation de complexes métalliques du 2MBI
I.2.4. Comportement du 2MBI aux interfaces électrode | solution
I.2.4.1. Adsorption du 2MBI sur électrodes métalliques
I.2.4.2. Oxydation de la molécule 2MBI
I.2.5. Influence des SAMs du 2MBI et du 2MBI-5-S sur le transfert électronique
I.3. Conclusion et objectif du travail
Références bibliographiques
Chapitre II Réactifs, matériels et méthodes d’étude
II.1 Réactifs, Matériels et formation de SAMs
II.1.1. Réactifs et formation de SAMs
II.1.1.1. Réactifs
II.1.1.2.Formation des SAMs
II.1.2. Cellule électrochimique de mesure et électrodes
II.1.3. Montage électrochimique
II.2 Méthodes d’étude
II.2.1. Modélisation par DFT
II.2.1.1. Théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT)
II.2.1.1.1. Fondement de la théorie (DFT)
II.2.1.1.2.Théorèmes de Hohenberg et Khon
II.2.1.1.3. L’ansatz de Kohn et Sham
II.2.1.1.4. Fonctionnelle d’échange-corrélation
II.2.1.1.5. Fonctionnelle PBE et base Land2dz utilisés dans les calculs
II.2.1.2. Logiciel et procédure de calcul
II.2.1.2.1. Présentation du logiciel utilisé
II.2.1.2.2. Construction et optimisation et détails de calcul
II.2.2. Voltampérométrie cyclique
II.2.1.1. Cas d’un système rapide (réversible)
II.2.1.2. Cas d’un système quasi-rapide
II.2.1.3. Cas d’un système lent
II.2.3.Tracés des droites de Tafel
II.2.4. Analyse des voltamogrammes par semi-intégration
II.2.5. Calcul des voltamogrammes (simulation)
Références bibliographiques
Chapitre III Etude par DFT de l’interaction du 2MBI
avec l’or, le palladium et le nickel
III.1. Résultats et discussion
III.1.1. Géométrie moléculaire du 2MBI
III.1.2. Géométrie moléculaire des complexes 2MBI-Au, 2MBI-Pd et 2MBI-Ni
III.1.3. Energie d’optimisation et énergie de liaison
III.1.4. Charges atomiques de Mulliken
Table des matières
III.1.5. Energies HOMO, LUMO, gap d’énergie et moment dipolaire
Conclusions
Références bibliographiques
Chapitre IV Caractérisation électrochimique des électrodes d’or polycristallin en absence
et en présence des monocouches auto-assemblées de 2MBI et 2MBI-5-S
IV.1. Caractérisation électrochimique de l’électrode d’or polycristallin en absence des monocouches auto-assemblées dans des milieux de pH différents
IV.1.1. Milieu acide perchlorique
IV.1.2. Milieu perchlorate de potassium
IV.1.3. Milieu hydroxyde de potassium
IV.2. Caractérisation électrochimique de l’électrode d’or polycristallin en présence des monocouches auto-assemblées de 2MBI et 2MBI-5-S dans des milieux différents
IV.2.1. Entretien et activation de l’électrode
IV.2.1.1 Polissage mécanique
IV.2.1.2.Traitement électrochimique dans l’acide sulfurique
IV.2.2. Etude par voltampérométrie
IV.2.2.1.Comportement de l’électrode modifiée par 2MBI et 2MBI-5-S
en milieu perchlorate de potassium
IV.2.2.2.Désorption oxydative des films de 2MBI et de 2MBI-5-S en milieu  perchlorate de potassium
IV.2.2.3.Comportement de la monocouche de 2MBI et de 2MBI-5-S dans le
domaine idéalement polarisable de l’électrode d’or dans des milieux de différents
IV.2.2.3.1.Milieu acide perchlorique
IV.2.2.3.2.Milieu perchlorate de potassium
IV.2.2.3.3.Milieu hydroxyde de potassium
IV.2.2.3.3.1.Calcul de la charge et l’excès superficiel
IV.2.2.3.3.2.Influence de la vitesse de balayage
IV.2.3. Comportement de l’électrode d’or modifiée par 2MBI et 2MBI-5-S en 5 présence du couple ferro-ferricyanide en milieu perchlorate de potassium
IV.2.3.1. Etude par semi-intégration
IV.2.3.2. Etude par Simulation
IV.2.3.2.1. Calcul des coefficients de transferts par le tracé des droites de Tafel
IV.2.3.2.2. Calcul des voltampérogrammes théoriques relative à l’oxydo- réduction de l’espèce ferro-ferricyanide en présence et en absence de la monocouche de 2MBI-5-S
Références bibliographique

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