Étude phyto et biochimique de trois variétés de Carica papaya L. cultivées

Étude phyto et biochimique de trois variétés de
Carica papaya L. cultivées

Flavonoïdes 

Les flavonoïdes représentent les composés majoritaires des polyphénols. Ils sont composés de deux cycles benzéniques notés A et B reliés par un chaînon de trois atomes de carbones qui peut évoluer en hétérocycles (Figure 14). Par la diversité des structures, on distingue plus de dix groupes dont les plus importants sont les flavonols, les flavones, les flavan-3-ols, les anthocyanidines, les flavanones et les isoflavones. Pour différencier les catégories de flavonoïdes, on se base sur la structure et le niveau d’oxydation du l’hétérocycle central. Pour chaque type de flavonoïdes, il peut exister des variations sur le squelette : (1) Le niveau d’hydroxylation (2) Le niveau de méthoxylation 22 (3) Le niveau de glycosylation ; exception faite de certains flavonoïdes existant sous forme libre. La majorité des flavonoïdes sont liés à un ou plusieurs oses. OH O A B O O A B C Figure 14 : Structure de base des flavonoïdes Chalcones Chez les chalcones (Figure 15), l’hétérocycle n’est pas formé. C’est un métabolite secondaire synthétisé par plusieurs plantes et c’est également un intermédiaire de synthèse pour les flavonoïdes. Elle apporte une contribution dans la coloration des plantes. O A B O A B O OH Squelette de base des chalcones Cordoïne Figure 15 : Structure de base des chalcones et exemple 

 Flavanones

 Les flavanones sont caractérisés par la formation d’un hétérocycle saturé (Figure 16). Ils sont principalement trouvés dans les agrumes. O O Figure 16 : Squelette de base des flavanones 

Flavonols 

Les flavonols ont une structure similaire à celle des flavanones mais l’hétérocycle est insaturé (Figure 17). Ils différent des flavones par la présence de groupement(s) hydroxyle(s). On peut les retrouver sous leur forme libre (aglycone) comme la quercétine ou liés à un ou plusieurs sucres (hétérosides) comme la rutine (Figure 17). Ils sont majoritairement trouvés dans les oignons, le poireau, le chou ou les baies. 24 O O O O HO OH R2 R1 OH Squelette de base des flavones Flavonols (Quercétine : R1 = R2 =-OH) O O HO OH O OH OH O H H OH OH O O OH OH HO H H H H H OH H Rutine Figure 17 : Squelette des flavonols et exemple

 Flavan-3-ol

s Les flavan-3-ols constituent la classe de flavonoïdes ayant les structures les plus complexes. Ils peuvent être composés de monomère tel que la catéchine ou de polymères comme les proanthocyanidines. Ils peuvent être estérifiés par l’acide gallique et/ou subir d’autres réactions d’hydroxylation conduisant ainsi à des structures de plus en plus complexes telles que les gallocatéchines ou les épigallocatéchines (Figure 18). 25 R HO O OH OH OH R’ Squelette de base des flavan-3-ol OH HO O OH OH OH OH HO O OH OH OH (+)-Catéchine (-)-Catéchine O HO O OH OH OH O OH OH OH OH O HO O OH OH OH O OH OH OH OH Catéchine gallate Épicatéchine gallate Figure 18 : Structure des Flavan-3-ols et exemples On retrouve les flavan-3-ols dans les fruits comme l’abricot, dans le chocolat noir et principalement dans le thé noir. 

Anthocyanines 

Les anthocyanes ou anthocyanines (du grec anthos = fleur, kyáneos = pourpre) sont des pigments naturels solubles dans l’eau avec des couleurs allant du rouge au bleu. Elles sont présentes dans les fruits, dans les feuilles et les racines de diverses plantes terrestres mais absents des animaux et des plantes aquatiques. Dans ce type de flavonoïdes l’hétérocycle formé 26 est doublement insaturé donnant ainsi à l’oxygène un caractère déficitaire en électron mais stabilisé par la résonance. Ce sont des pigments naturels qui sont stables surtout quand ils sont liés avec des oses. Dans cette catégorie on trouve la cyanine, la delphinidine, la péonidine et la malvidine (Figure 19). Ces composés sont largement présents dans le vin rouge, les oignons rouges et l’oseille rouge. Les anthocyanines sont caractéristiques pour leurs propriétés antioxydantes. Les anthocyanines sont favorables au maintien de la bonne santé et notamment contre le vieillissement cellulaire. Ils permettent également aux plantes de se protéger des radiations ultraviolettes. O OH HO OH OH OH ClO OH HO OH OH OH OH ClCyanine Delphinidine O OH HO OH OH O ClO OH HO OH OH O O ClPéonidine Malvidine Figure 19 : Structures des anthocyanines et exemples La différentiation des anthocyanines se fait par leur degré d’hydroxylation et d’O-méthylation et par le nombre et la position des oses branchés sur le squelette. Dans beaucoup d’espèces on trouve des anthocyanines monoglucosylées ou diglucosylées en forte teneur (Figure 20). 27 O O HO OH OH O O O OH OH HO HO O O HO O OH O HO OH OH OH OH HO OH OH Malvidine-3-glucose Péodinine-3,5-diglucose Figure 20 : Structures d’anthocyanines glycosylées 

Tanins 

Les formes condensées des polyphénols sont représentées par les tanins et les lignines. Elles sont obtenues par la condensation des formes simples (acides phénoliques et flavonoïdes) des polyphénols. Cette réaction permet d’avoir des composés beaucoup plus complexes qui peuvent présenter encore une hydro solubilité (tanins) ou avoir un caractère lipophile (lignines). Les tanins sont utilisés depuis l’antiquité pour leur faculté à tanner et/ou brunir les peaux d’animaux. Ils sont responsables de l’astringence de certains fruits et des produits transformés qui en découlent comme le vin. On distingue deux types de tanins : les hydrolysables et les condensés. Ils sont différents par leurs compositions et leurs propriétés physico-chimiques. •Les tanins hydrolysables (Figure 21) sont formés par la condensation de l’acide gallique ou d’un de ses dimères comme l’acide éllagique avec un ose ou de l’acide quininique. Ces tanins peuvent subir une hydrolyse chimique alcaline ou acide ou bien une hydrolyse enzymatique. 28 1,2,3,4,6-Pentagalloylglucose Castalgine Acutissimine Casuarictine Figure 21 : Structures de certains tanins hydrolysables • Les tanins condensés ou proanthocyanidines résultent de la condensation de 2 à plusieurs flavan-3-ols, parfois d’unités flavan-3,4-ols. Les unités monomériques formant les tanins condensés sont des dérivés de la catéchine ou d’un de ses isomères. Les tanins condensés ne sont hydrolysables que sous des conditions chimiques très agressives. Les unités de base des tanins condensés peuvent se lier de manière linéaire par des liaisons C-C ou se ramifier par des liaisons C-O-C. Ce sont donc des mélanges de plusieurs polyflavonoïdes (Tableau 3) On les trouve en grandes quantités dans certains fruits (pommes, raisins, prune, …) et dans certaines boissons fermentées ou non (thé, cidre, bissap, vin…)

Table des matières

Introduction
Étude bibliographique
I. Présentation du papayer Carica papaya L
I.1 Famille des Caricacées
I.2 Carica papaya L.
I.3 Données économiques liées à la production de Carica papaya L.
II. La phytochimie des végétaux
II.1 Alcaloïdes.
II.2 Composés terpéniques
II.3 Saponines
II.4 Polyphénols
Généralités
Acides phénoliques
Dérivés de l’acide benzoïque
Dérivés de l’acide cinnamique
Remarques
Flavonoïdes
Chalcones
Flavanones
Flavonols
Flavan-3-ols
Anthocyanines
Tanins
Biosynthèse des polyphénols
Synthèse des acides hydroxycinnamiques
Synthèse des flavonoïdes
III. Les métabolites primaires des végétaux
III.1 Protéines
Diversité des protéines
Les acides aminés
Propriétés chimiques
Acides aminés hydrophobes
Acides aminés polaires
Acides aminés chargés à pH 7
Propriétés physiques
Liaison peptidique
Structure protéique
Structure primaire
Structure secondaire.
Hélice α
Feuillet plissé β
Structures secondaires irrégulières
Structure tertiaire
Structure quaternaire
Biosynthèse des protéines
Élucidation du code génétique
Redondance du code génétique
Synthèse des protéines
Transcription
Spécificités de la transcription chez les Eucaryotes
Action de l’ARN polymérase II
Traduction
Ribosomes
ARNt
Traduction
III.2 Lipides
Propriétés des lipides
Classification des lipides
Acides gras
Acylglycérols
Monoacylglycérols
Diacylglycérols
Triacylglycérols
Glycérophospholipides
Sphingolipides
Sphingosine
Céramides
Phosphosphingolipides
Glycosphingolipides
Cholestéro
Métabolisme lipidique
La β-oxydation des acides gras
Activation des acides gras
β-oxydation des acides gras saturés
β-oxydation des acides gras insaturés
Synthèse des acides gras
Transport de l’acétylCoA
Carboxylation de l’acétylCoA
Synthèse des acides gras
Synthèse du palmitate
Élongation et désaturation du palmitate
III.3 Glucides
Structures et propriétés des glucides
Classification
Monosaccharides
Oligosaccharides
Polysaccharides
Dérivés d’oses
Osamines
Acides uroniques
Polyols
Métabolisme du Glucose
Description de la glycolyse
Néoglucogenèse
Partie expérimentale
I. Matériel et Méthodes
I.1 Matériel végétal
I.2 Méthodes
Évaluation phyto et biochimique
Polyphénols, saponines et activité antioxydante
Optimisation des paramètres d’extraction
Température
Durée
Ratio
Dosage des polyphénols
Dosage des flavonoïdes
Dosage des proanthocyanidines
Détermination de la capacité antioxydante totale, de l’activité antioxydante et de la CI5 : méthode ABTS•+
Détermination de la capacité antioxydante : méthode CUPRAC
Dosage des Saponines
Lipides 8
Extraction de l’huile à partir des graines de Carica papaya L3
Détermination des indices
Indices d’acidité (IA)
Indice de saponification (IS)
Indice d’iode (II)
Indice de peroxyde (IP)
Extraction et dosage des polyphénols et flavonoïdes de l’huile de papaye de Red
Lady
Extraction des polyphénols et flavonoïdes
Dosage des polyphénols totaux
Dosage des flavonoïdes totaux
Mesure de l’activité antioxydante des huiles par DPPH•
Détermination de la capacité calorifique des huiles7
Étalonnage
Mesure des capacités calorifiques des huiles des variétés 1 et 2
Dosage des acides gras
Dosage des stérols
Analyse DSC de l’huile
Analyse IR de l’huile
Protéines
Extraction des protéines de réserve
Dosage des protéines par la méthode de Bradford
Chromatographies
Préparation des gels
Mise en œuvre
Électrophorèse SDS-AGE
Préparation du gel d’électrophorèse
Préparation et dépôt des protéines
Migration des protéines
Coloration et séchage du gel
Lecture spectrométrique UV des protéines
Dosage acide/base
Voies de valorisation des sous-produits du papayer
Utilisation des graines de papayer dans l’adsorption des colorants
Préparation de l’adsorbant
Détermination du point zéro charge (pHPZC)
Caractérisation de l’adsorbant par la méthode de Boehm
Caractérisation de l’adsorbant par SEM et DRX
Tests d’adsorption par Batch
Effet du contact temporel
Effet de la dose d’adsorbant sur la capacité d’élimination
Effet du pH de la solution sur la capacité d’élimination
Utilisation des feuilles de papayer dans l’élimination des métaux lourds
Analyse statistique
II. Résultats et Discussion
II.1 Composants phytochimiques et activités antioxydantes
Détermination des conditions optimales d’extraction des polyphénols
Teneurs des polyphénols dans les sous-produits de Carica papaya L 2
Détermination du contenu total en polyphénols
Teneur total en flavonoïdes
Détermination du contenu total en proanthocyanidines
Teneur en saponines
Étude de l’activité antioxydante des extraits aqueux
Capacité antioxydante totale déterminée par la méthode CUPRAC
Capacité antioxydante et CI5 par la méthode DPPH•
Capacité antioxydante par la méthode DPPH
Détermination de la CI5
Cinétique réactionnelle
Résultats de l’activité antioxydante par la méthode ABT
Capacité antioxydante totale
Détermination de la CI5
Cinétique réactionnelle
II.2 Caractérisation des huiles
Rendement d’extraction, détermination des indices et des pouvoirs calorifiques de l’huile
Analyse IR de l’huile extraite de la variété Red Lady
Détermination du contenu total en polyphénols et flavonoïdes
Activité antioxydante de l’huile de papaye
Composition en acide gras
Résultats de la calorimétrie différentielle de l’huile de Carica papaya L.
Composition en stérols
II.3 Protéines de réserve des graines de papayer
Extraction et dosage des protéines
Composition en acides aminés des deux classes majoritaires de protéines
Analyse infrarouge
IR globulines
IR albumines
Étude des chromatographies
Chromatographie gel-filtration
Chromatographie échangeuse d’anion
Analyse de l’électrophorèse
Titrage acide/base
Étude des spectres UV en fonction du pH
II.4 Élimination des colorants
Caractérisation de l’adsorbant
Optimisation des paramètres d’extraction
Aspects cinétiques
Modèle de pseudo-premier ordre
Modèle de pseudo-second ordre
Modèle de diffusion intraparticulaire
Modèle Elovich
Isothermes
II.5 Élimination les métaux lourds
Optimisation des paramètres de réduction des métaux lourds en milieu aqueux
Cinétiques d’adsorption
Isothermes d’adsorption.
Conclusion et perspectives
Bibliographie et webographie
Introduction
Depuis que l’espèce humaine est apparue sur Terre, l’Homme a dû trouver des moyens de se prémunir de son environnement. Pour cela

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